马山位于即墨城区西4公里处，由四峰一岭组成，主峰海拔233米，突起于市境西部，因其东西两峰并峙，形如马鞍，故又称“马鞍山”。其南控胶济铁路，东屏即墨市区，在军事上有重要意义。马山是一座地质宝库，主要有柱状节理石柱群、硅化木、沉积岩构造、接触变质带、水撞崖等独特自然景观。马山因奇特的地质现象被地质专家们誉为“袖珍式的自然地质博物馆”。1993年，马山被山东省政府批准为省级地质遗迹自然保护区，翌年被国务院批准为国家级自然保护区。

    马山石林为柱状节理石柱群，位于马山西南坡之团山，面积约1平方公里。据考证，此山系一亿年前由火山岩浆冷凝而成。现裸露部分高达28米，厚约20米，跨度为150米。其排列紧密，笔直挺拔，恰似一片密林，故名“马山石林”。柱状节理石林多发育于玄武岩中，一般呈六棱或五棱柱状，而马山石林发育于安山岩中，且呈四方形，在地质学中较为罕见。国内外专家称该石林无论从规模上还是科研价值上，都可与世界闻名的英国玄武岩柱状节理“巨人堤”和美国响岩体柱状节理“魔鬼塔”相媲美。

    硅化木广布于马山周围的沉积岩中。据专家考证，早在1亿年前的中生代，马山地区曾为“古莱阳湖”的一部分，其上游生长着大量的古树，因种种自然原因，其树顺流而下，被搁浅在这里，地壳变动时，在高温、高压、断氧之特定自然条件下，形成化石。马山硅化木分布较广，现已发现20多株。其木质构造属松柏类的南洋杉科。1983年发现的一棵重约2吨，长6米，粗端直径70厘米，细端直径60厘米，属白垩纪。1992年发现的一棵硅化木，树干长13米，直径1.2米，年轮清晰，树皮保存完整，具有重要的科研和观赏价值。为防止发掘后风化及人为破坏，即墨市在原址上建造了硅化木馆加以保护，使之成为永久性的科研课堂和旅游景观。